微生物實驗室建設要不同于一般的實驗室工程或凈化工程。主要應用于微生物學、生物醫學、生物化學、動物實驗、基因工程以及生物制品研究使用的實驗室統稱為生物安全實驗室,一般由主體實驗室和輔助功能實驗室組成。微生物安全實驗室必須保證人身安全、環境安全、廢棄物安全和樣本安全，能長期而安全的運行，同時還為需要實驗室工作人員提供一個舒適，而良好的工作環境。
一、意義及目的微生物學是研究微生物及其生命活動的科學。微生物具有種類繁多、體積微小、代謝類型多、代謝強度高、生長繁殖速度快、容易變異等多種特點。它廣泛分布于空氣、水、土壤、人體及動植物體,營獨立或寄生生活。大多數微生物對人類和動植物是有益的,特別是它與人類的生活有密切的關系，對工農業生產、人類的生活環境和健康衛生有極大的影響。
隨著新課程改革，中學微生物在中學教學中的篇幅也有所增加，微生物學實驗不僅綜合性和操作性強,而且要求學生具備較強的無菌操作技能和生物安全意識。對培養學生理論聯系實際、動手能力、分析解決問題能力、科學思維等有重要意義。
二、功能與要求微生物實驗室的主要設備有:發酵罐、高壓滅菌鍋、超凈工作臺、電熱恒溫培養箱、恒溫恒濕培養箱、電熱鼓風干燥箱、移液器、奧林巴斯顯微鏡、冰箱、全溫振蕩器、遠紅外快速干燥箱等現代化高科技實驗設備。實驗室可以進行微生物的培養，微生物代謝產物的生產與分離，食品及飲用水微生物指標檢測，微生物的篩選等實驗。能夠較好的完成教材教學實驗的需要，同時現代化的儀器配置可以滿足學生的興趣探究活動。
微生物實驗室由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是地板和墻壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便于打掃衛生。
三、微生物實驗室基本要求微生物實驗室準備室用于配制培養基和樣品處理等。室內設有試劑柜、存放器具或材料的專柜、實驗臺、電爐、冰箱和上下水道、電源等。
洗滌室用于洗刷器皿等。由于使用過的器皿已被微生物污染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下應設置洗滌室。室內應備有加熱器、蒸鍋,洗刷器皿用的盆、桶等，還應有各種瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
四、滅菌室滅菌室主要用于培養基的滅菌和各種器具的滅菌，室內應備有高壓蒸汽滅菌器、烘箱等滅菌設備及設施。
潔凈室五、無菌室無菌室也稱接種室,是系統接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室。在微生物中，菌種的接種移植是一項主要操作,這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的污染。在一般環境的空氣中，由于存在許多塵埃和雜菌，很易造成污染，對接種工作干擾很大。
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